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- 綠色的圓圈代表本校廣闊的綠色校園，圓圈也代表圓滿、團結之意，希望本校校務在全校師生、家長及社區的關懷合作之下，大家同心協力為地方教育而努力。
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- 五棵樹代表五林綠樹成蔭的樹林，象徵本校的校務興盛，教學成果豐碩，為社區、國家培養許多優秀人才。五棵樹也象徵本校真誠、精進、健康、快樂、特色的五大發展願景。本校未來的教育方向，將配合教育部九年一貫新課程的實施，以五大發展願景為導向。規劃及實施教學本位課程，以培養五育均衡發展，具有本校特色的優秀國民。
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- 藍色代表流水，一方面代表五里林溪，提醒本校師生不要忘記過去本庄因為常淹水，被稱為水流庄，先民不畏環境的艱難，刻苦奮鬥的精神。二方面，流水也代表著海洋，在海洋的上方，有一艘白色的船，插著五支船帆，航向世界各地。象徵五林兒童具有國際觀，將來前途無限寬廣，所謂立足台灣、胸懷大陸放眼天下。
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- 最下方是一雙代表熱誠的橘色雙手，向上扶著五林，代表大家對五林國小的支持，五林國小不只是全校師生學習、生活場所；它也是社區居民的精神堡壘，與終身學習、休閒及運動的地方，更是國家培養優秀國民的搖籃。值得大家為五林國小同心協力、犧牲奉獻。使五林國小校務蒸蒸日上，大家都健康快樂。
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